銜接上季。忍者們離開神秘島，但妮婭的水系元素突然失去了控制，在尋找問題之時，突然收到來自海底的一個能量波，于是闖入了水下五千英尋的無盡大海神殿，里面生活著許多海怪（莫羅匹恩人），他們被一個叫特里瑪?shù)恼卖~怪領導著，但是他的兒子卡爾瑪卻內心邪惡，他決定用兩個護身符（風暴護身符和海浪護身符）來喚醒海上巨蟒“沃杰拉”，來造出驚人的破壞力?？柆敒榱藢崿F(xiàn)計劃，害死了他的爸爸并嫁禍忍者，后得到兩個護身符，喚醒了沃杰拉，水淹忍者城。忍者城居民的處境十分危險。本多瑪擊碎卡爾瑪?shù)臋嗾?，卡爾瑪失去對沃杰拉的控制，被沃杰拉吞食。妮雅為了擊敗沃杰拉，不顧自身與海洋融為了一體，最終打敗了沃杰拉，妮雅將海水帶出忍者城，自己也留在了海水中。
蘇妮特·瑪尼 烏米·馬薩庫 阿莉雅·肖卡特 鮑勃·斯蒂芬森 泰德·特拉維爾斯特德 寶拉雅娜·麥金托什 達什·威廉姆斯 斯凱勒·吉桑多 塞皮德·莫阿菲 克里斯·迪亞曼托普洛斯 奧基里特·奧諾多瓦
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